1、生物效应不同。Kellogg的空气负离子体外抑菌和付正恺的免吸入负氧离子体内两个具有代表性实验表明，负氧离子未产生自由基作用，相反，负氧离子却在体内有抑制自由基作用。

2、负氧离子与自由基的产生和来源不同。负氧离子是在大自然界中产生，由于氧捕获一个电子，是过饱和电子物质。自由其在体内多种细胞酶电 子转移中产生，是不饱和电子物质。

3、两者的电化学行为不同。负氧离子属于单电子转移，电子易放出和转移，而过氧化物自由基是电子多位吸附，并比较牢固。

4、两者电子自旋不同。空气负氧离子是逆时针自旋，而自由基则是顺时针自旋。